Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms