Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF4Q08170 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms