Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLEQ07864 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLEQ07864 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLEQ07864 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLEQ07864 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLEQ07864 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLEQ07864 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLEQ07864 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLEQ07864 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLEQ07864 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLEQ07864 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLEQ07864 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
POLEQ07864 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLEQ07864 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLEQ07864 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLEQ07864 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
POLEQ07864 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLEQ07864 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLEQ07864 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLEQ07864 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLEQ07864 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLEQ07864 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLEQ07864 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLEQ07864 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLEQ07864 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLEQ07864 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLEQ07864 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLEQ07864 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLEQ07864 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLEQ07864 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POLEQ07864 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POLEQ07864 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLEQ07864 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLEQ07864 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLEQ07864 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLEQ07864 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLEQ07864 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLEQ07864 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLEQ07864 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLEQ07864 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLEQ07864 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLEQ07864 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLEQ07864 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLEQ07864 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLEQ07864 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POLEQ07864 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLEQ07864 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLEQ07864 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLEQ07864 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLEQ07864 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLEQ07864 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POLEQ07864 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLEQ07864 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms