Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms