Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms