Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF11Q05519 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF11Q05519 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms