Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms