Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms