Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms