Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CBX1P83916 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CBX1P83916 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CBX1P83916 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CBX1P83916 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CBX1P83916 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CBX1P83916 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CBX1P83916 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CBX1P83916 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CBX1P83916 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CBX1P83916 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CBX1P83916 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CBX1P83916 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CBX1P83916 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CBX1P83916 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CBX1P83916 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CBX1P83916 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CBX1P83916 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CBX1P83916 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CBX1P83916 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CBX1P83916 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CBX1P83916 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CBX1P83916 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CBX1P83916 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CBX1P83916 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CBX1P83916 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CBX1P83916 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CBX1P83916 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CBX1P83916 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CBX1P83916 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CBX1P83916 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CBX1P83916 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CBX1P83916 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CBX1P83916 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CBX1P83916 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CBX1P83916 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CBX1P83916 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CBX1P83916 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBX1P83916 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBX1P83916 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBX1P83916 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBX1P83916 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBX1P83916 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBX1P83916 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBX1P83916 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBX1P83916 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBX1P83916 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBX1P83916 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CBX1P83916 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBX1P83916 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBX1P83916 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBX1P83916 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBX1P83916 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBX1P83916 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBX1P83916 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX1P83916 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX1P83916 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX1P83916 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX1P83916 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX1P83916 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX1P83916 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX1P83916 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX1P83916 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX1P83916 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX1P83916 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX1P83916 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX1P83916 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX1P83916 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX1P83916 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX1P83916 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX1P83916 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX1P83916 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX1P83916 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX1P83916 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX1P83916 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX1P83916 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX1P83916 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX1P83916 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX1P83916 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX1P83916 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX1P83916 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX1P83916 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX1P83916 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX1P83916 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX1P83916 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX1P83916 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX1P83916 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX1P83916 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX1P83916 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX1P83916 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX1P83916 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX1P83916 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX1P83916 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX1P83916 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX1P83916 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX1P83916 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX1P83916 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX1P83916 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX1P83916 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX1P83916 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms