Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRX3P78415 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRX3P78415 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRX3P78415 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRX3P78415 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRX3P78415 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRX3P78415 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRX3P78415 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRX3P78415 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRX3P78415 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRX3P78415 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRX3P78415 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRX3P78415 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRX3P78415 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRX3P78415 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRX3P78415 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRX3P78415 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRX3P78415 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRX3P78415 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRX3P78415 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRX3P78415 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRX3P78415 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRX3P78415 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRX3P78415 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRX3P78415 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRX3P78415 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRX3P78415 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRX3P78415 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRX3P78415 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRX3P78415 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRX3P78415 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRX3P78415 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRX3P78415 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRX3P78415 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRX3P78415 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRX3P78415 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRX3P78415 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRX3P78415 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRX3P78415 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
IRX3P78415 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
IRX3P78415 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRX3P78415 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRX3P78415 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRX3P78415 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRX3P78415 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRX3P78415 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX3P78415 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX3P78415 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX3P78415 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX3P78415 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX3P78415 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX3P78415 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX3P78415 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX3P78415 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX3P78415 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX3P78415 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX3P78415 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX3P78415 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX3P78415 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX3P78415 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX3P78415 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX3P78415 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX3P78415 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX3P78415 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX3P78415 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX3P78415 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX3P78415 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX3P78415 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX3P78415 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX3P78415 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX3P78415 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX3P78415 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX3P78415 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX3P78415 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX3P78415 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX3P78415 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX3P78415 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX3P78415 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX3P78415 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX3P78415 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX3P78415 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX3P78415 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX3P78415 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX3P78415 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX3P78415 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX3P78415 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX3P78415 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX3P78415 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX3P78415 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX3P78415 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX3P78415 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX3P78415 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX3P78415 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX3P78415 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX3P78415 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX3P78415 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX3P78415 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX3P78415 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX3P78415 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX3P78415 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms