Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms