Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GEMP55040 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GEMP55040 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GEMP55040 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GEMP55040 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GEMP55040 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GEMP55040 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GEMP55040 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GEMP55040 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GEMP55040 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GEMP55040 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GEMP55040 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GEMP55040 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GEMP55040 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GEMP55040 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GEMP55040 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GEMP55040 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GEMP55040 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GEMP55040 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GEMP55040 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GEMP55040 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GEMP55040 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GEMP55040 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GEMP55040 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GEMP55040 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GEMP55040 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GEMP55040 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GEMP55040 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GEMP55040 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GEMP55040 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GEMP55040 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GEMP55040 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEMP55040 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEMP55040 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEMP55040 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEMP55040 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEMP55040 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEMP55040 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GEMP55040 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEMP55040 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEMP55040 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GEMP55040 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEMP55040 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEMP55040 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEMP55040 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEMP55040 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEMP55040 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEMP55040 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GEMP55040 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEMP55040 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEMP55040 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEMP55040 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEMP55040 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEMP55040 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEMP55040 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEMP55040 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEMP55040 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEMP55040 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms