Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms