Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DAP3P51398 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DAP3P51398 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DAP3P51398 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DAP3P51398 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DAP3P51398 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DAP3P51398 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DAP3P51398 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DAP3P51398 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DAP3P51398 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DAP3P51398 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DAP3P51398 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DAP3P51398 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DAP3P51398 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DAP3P51398 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DAP3P51398 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DAP3P51398 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DAP3P51398 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DAP3P51398 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DAP3P51398 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DAP3P51398 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DAP3P51398 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DAP3P51398 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DAP3P51398 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DAP3P51398 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DAP3P51398 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DAP3P51398 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DAP3P51398 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DAP3P51398 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DAP3P51398 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DAP3P51398 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DAP3P51398 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DAP3P51398 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DAP3P51398 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DAP3P51398 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DAP3P51398 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DAP3P51398 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DAP3P51398 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DAP3P51398 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DAP3P51398 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DAP3P51398 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DAP3P51398 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DAP3P51398 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DAP3P51398 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DAP3P51398 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DAP3P51398 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DAP3P51398 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DAP3P51398 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DAP3P51398 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DAP3P51398 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DAP3P51398 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DAP3P51398 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DAP3P51398 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DAP3P51398 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DAP3P51398 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DAP3P51398 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DAP3P51398 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DAP3P51398 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DAP3P51398 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DAP3P51398 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DAP3P51398 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DAP3P51398 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DAP3P51398 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms