Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCR1P46094 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCR1P46094 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCR1P46094 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCR1P46094 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCR1P46094 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCR1P46094 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCR1P46094 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCR1P46094 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCR1P46094 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCR1P46094 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCR1P46094 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCR1P46094 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
XCR1P46094 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCR1P46094 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
XCR1P46094 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCR1P46094 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCR1P46094 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCR1P46094 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCR1P46094 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCR1P46094 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCR1P46094 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCR1P46094 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCR1P46094 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCR1P46094 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XCR1P46094 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XCR1P46094 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XCR1P46094 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XCR1P46094 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XCR1P46094 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
XCR1P46094 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XCR1P46094 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XCR1P46094 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XCR1P46094 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XCR1P46094 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XCR1P46094 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XCR1P46094 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XCR1P46094 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XCR1P46094 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XCR1P46094 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
XCR1P46094 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XCR1P46094 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XCR1P46094 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XCR1P46094 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XCR1P46094 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XCR1P46094 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XCR1P46094 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XCR1P46094 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XCR1P46094 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XCR1P46094 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XCR1P46094 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XCR1P46094 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XCR1P46094 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XCR1P46094 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XCR1P46094 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XCR1P46094 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XCR1P46094 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
XCR1P46094 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XCR1P46094 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XCR1P46094 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XCR1P46094 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XCR1P46094 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XCR1P46094 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XCR1P46094 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XCR1P46094 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XCR1P46094 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XCR1P46094 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XCR1P46094 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
XCR1P46094 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XCR1P46094 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XCR1P46094 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XCR1P46094 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XCR1P46094 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XCR1P46094 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XCR1P46094 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XCR1P46094 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XCR1P46094 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XCR1P46094 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XCR1P46094 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XCR1P46094 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCR1P46094 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCR1P46094 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCR1P46094 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCR1P46094 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCR1P46094 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCR1P46094 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
XCR1P46094 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCR1P46094 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCR1P46094 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCR1P46094 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCR1P46094 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCR1P46094 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCR1P46094 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCR1P46094 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCR1P46094 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCR1P46094 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCR1P46094 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCR1P46094 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
XCR1P46094 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCR1P46094 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms