Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL1P40616 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL1P40616 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL1P40616 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL1P40616 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL1P40616 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL1P40616 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL1P40616 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL1P40616 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL1P40616 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL1P40616 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL1P40616 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL1P40616 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL1P40616 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL1P40616 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL1P40616 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL1P40616 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL1P40616 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL1P40616 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL1P40616 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL1P40616 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL1P40616 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL1P40616 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL1P40616 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL1P40616 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL1P40616 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL1P40616 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL1P40616 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL1P40616 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL1P40616 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL1P40616 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL1P40616 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL1P40616 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL1P40616 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL1P40616 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL1P40616 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL1P40616 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL1P40616 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL1P40616 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL1P40616 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL1P40616 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL1P40616 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARL1P40616 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARL1P40616 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARL1P40616 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARL1P40616 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARL1P40616 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARL1P40616 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARL1P40616 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARL1P40616 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARL1P40616 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ARL1P40616 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARL1P40616 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ARL1P40616 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARL1P40616 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ARL1P40616 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARL1P40616 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARL1P40616 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARL1P40616 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ARL1P40616 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARL1P40616 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARL1P40616 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL1P40616 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL1P40616 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL1P40616 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL1P40616 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL1P40616 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL1P40616 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL1P40616 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL1P40616 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL1P40616 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL1P40616 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL1P40616 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL1P40616 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL1P40616 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL1P40616 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL1P40616 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL1P40616 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL1P40616 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL1P40616 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL1P40616 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL1P40616 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL1P40616 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL1P40616 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL1P40616 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL1P40616 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL1P40616 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL1P40616 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL1P40616 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL1P40616 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL1P40616 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL1P40616 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ARL1P40616 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ARL1P40616 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL1P40616 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL1P40616 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL1P40616 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL1P40616 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL1P40616 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL1P40616 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms