Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM5P33992 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM5P33992 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM5P33992 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM5P33992 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM5P33992 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM5P33992 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM5P33992 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM5P33992 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM5P33992 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM5P33992 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM5P33992 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM5P33992 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM5P33992 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM5P33992 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM5P33992 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM5P33992 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM5P33992 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM5P33992 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM5P33992 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM5P33992 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM5P33992 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM5P33992 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM5P33992 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM5P33992 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM5P33992 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM5P33992 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM5P33992 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM5P33992 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM5P33992 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MCM5P33992 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MCM5P33992 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM5P33992 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM5P33992 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM5P33992 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM5P33992 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM5P33992 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM5P33992 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM5P33992 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM5P33992 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM5P33992 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM5P33992 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM5P33992 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM5P33992 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM5P33992 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM5P33992 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM5P33992 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM5P33992 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM5P33992 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM5P33992 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM5P33992 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM5P33992 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM5P33992 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM5P33992 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM5P33992 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM5P33992 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM5P33992 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM5P33992 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM5P33992 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM5P33992 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM5P33992 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM5P33992 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM5P33992 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM5P33992 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM5P33992 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM5P33992 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM5P33992 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM5P33992 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM5P33992 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM5P33992 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM5P33992 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM5P33992 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM5P33992 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM5P33992 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM5P33992 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM5P33992 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM5P33992 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM5P33992 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM5P33992 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM5P33992 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM5P33992 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM5P33992 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM5P33992 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM5P33992 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM5P33992 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM5P33992 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM5P33992 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM5P33992 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM5P33992 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM5P33992 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM5P33992 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM5P33992 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM5P33992 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM5P33992 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM5P33992 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM5P33992 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM5P33992 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM5P33992 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM5P33992 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM5P33992 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms