Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCKBRP32239 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms