Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms