Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX2P28328 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX2P28328 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX2P28328 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX2P28328 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX2P28328 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX2P28328 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX2P28328 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX2P28328 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX2P28328 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX2P28328 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX2P28328 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX2P28328 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX2P28328 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX2P28328 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX2P28328 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX2P28328 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX2P28328 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX2P28328 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX2P28328 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PEX2P28328 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PEX2P28328 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PEX2P28328 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PEX2P28328 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PEX2P28328 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PEX2P28328 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PEX2P28328 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PEX2P28328 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PEX2P28328 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PEX2P28328 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX2P28328 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX2P28328 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX2P28328 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX2P28328 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX2P28328 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX2P28328 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX2P28328 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX2P28328 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX2P28328 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX2P28328 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX2P28328 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX2P28328 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX2P28328 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX2P28328 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX2P28328 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX2P28328 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX2P28328 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX2P28328 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX2P28328 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX2P28328 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX2P28328 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX2P28328 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX2P28328 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX2P28328 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX2P28328 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX2P28328 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX2P28328 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX2P28328 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX2P28328 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX2P28328 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX2P28328 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX2P28328 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX2P28328 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX2P28328 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX2P28328 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX2P28328 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX2P28328 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX2P28328 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX2P28328 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX2P28328 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX2P28328 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX2P28328 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX2P28328 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX2P28328 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX2P28328 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX2P28328 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX2P28328 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms