Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HTR2AP28223 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms