Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms