Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
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