Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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