Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms