Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAPN3P20807 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms