Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms