Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB3BP20337 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms