Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIG1P18858 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIG1P18858 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIG1P18858 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIG1P18858 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIG1P18858 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIG1P18858 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIG1P18858 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIG1P18858 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIG1P18858 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIG1P18858 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIG1P18858 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIG1P18858 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIG1P18858 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIG1P18858 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LIG1P18858 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIG1P18858 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIG1P18858 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIG1P18858 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIG1P18858 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIG1P18858 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIG1P18858 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LIG1P18858 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIG1P18858 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIG1P18858 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIG1P18858 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIG1P18858 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIG1P18858 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIG1P18858 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIG1P18858 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIG1P18858 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LIG1P18858 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LIG1P18858 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LIG1P18858 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LIG1P18858 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LIG1P18858 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LIG1P18858 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIG1P18858 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIG1P18858 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIG1P18858 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIG1P18858 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIG1P18858 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIG1P18858 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIG1P18858 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIG1P18858 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIG1P18858 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LIG1P18858 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIG1P18858 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIG1P18858 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIG1P18858 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIG1P18858 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIG1P18858 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LIG1P18858 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIG1P18858 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIG1P18858 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIG1P18858 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIG1P18858 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIG1P18858 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIG1P18858 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIG1P18858 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIG1P18858 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIG1P18858 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIG1P18858 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIG1P18858 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIG1P18858 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIG1P18858 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIG1P18858 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIG1P18858 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIG1P18858 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIG1P18858 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIG1P18858 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LIG1P18858 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LIG1P18858 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIG1P18858 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIG1P18858 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIG1P18858 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIG1P18858 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIG1P18858 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIG1P18858 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIG1P18858 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIG1P18858 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIG1P18858 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LIG1P18858 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIG1P18858 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIG1P18858 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIG1P18858 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIG1P18858 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIG1P18858 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIG1P18858 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIG1P18858 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIG1P18858 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIG1P18858 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIG1P18858 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIG1P18858 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIG1P18858 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIG1P18858 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIG1P18858 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIG1P18858 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LIG1P18858 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIG1P18858 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms