Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XBP1P17861 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
XBP1P17861 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XBP1P17861 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
XBP1P17861 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XBP1P17861 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XBP1P17861 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
XBP1P17861 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XBP1P17861 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XBP1P17861 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XBP1P17861 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
XBP1P17861 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
XBP1P17861 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
XBP1P17861 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
XBP1P17861 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
XBP1P17861 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
XBP1P17861 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
XBP1P17861 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
XBP1P17861 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
XBP1P17861 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XBP1P17861 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XBP1P17861 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
XBP1P17861 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XBP1P17861 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XBP1P17861 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XBP1P17861 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XBP1P17861 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XBP1P17861 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XBP1P17861 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XBP1P17861 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XBP1P17861 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XBP1P17861 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
XBP1P17861 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XBP1P17861 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XBP1P17861 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XBP1P17861 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XBP1P17861 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XBP1P17861 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XBP1P17861 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XBP1P17861 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XBP1P17861 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XBP1P17861 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XBP1P17861 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XBP1P17861 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XBP1P17861 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XBP1P17861 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XBP1P17861 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XBP1P17861 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
XBP1P17861 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XBP1P17861 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
XBP1P17861 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
XBP1P17861 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
XBP1P17861 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
XBP1P17861 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
XBP1P17861 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XBP1P17861 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XBP1P17861 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
XBP1P17861 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
XBP1P17861 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
XBP1P17861 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XBP1P17861 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
XBP1P17861 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
XBP1P17861 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
XBP1P17861 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
XBP1P17861 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XBP1P17861 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XBP1P17861 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
XBP1P17861 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XBP1P17861 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XBP1P17861 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XBP1P17861 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XBP1P17861 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XBP1P17861 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XBP1P17861 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XBP1P17861 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XBP1P17861 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
XBP1P17861 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XBP1P17861 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XBP1P17861 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XBP1P17861 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
XBP1P17861 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XBP1P17861 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XBP1P17861 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XBP1P17861 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XBP1P17861 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XBP1P17861 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XBP1P17861 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XBP1P17861 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XBP1P17861 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XBP1P17861 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XBP1P17861 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XBP1P17861 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XBP1P17861 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XBP1P17861 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XBP1P17861 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XBP1P17861 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XBP1P17861 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XBP1P17861 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XBP1P17861 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XBP1P17861 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms