Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms