Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms