Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms