Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYL1P12980 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYL1P12980 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYL1P12980 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYL1P12980 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYL1P12980 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LYL1P12980 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYL1P12980 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYL1P12980 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYL1P12980 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYL1P12980 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYL1P12980 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYL1P12980 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYL1P12980 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LYL1P12980 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LYL1P12980 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYL1P12980 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYL1P12980 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYL1P12980 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYL1P12980 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LYL1P12980 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYL1P12980 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYL1P12980 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LYL1P12980 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LYL1P12980 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LYL1P12980 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYL1P12980 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYL1P12980 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LYL1P12980 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYL1P12980 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYL1P12980 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYL1P12980 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYL1P12980 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYL1P12980 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYL1P12980 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYL1P12980 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYL1P12980 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYL1P12980 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYL1P12980 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYL1P12980 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYL1P12980 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYL1P12980 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYL1P12980 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYL1P12980 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYL1P12980 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYL1P12980 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYL1P12980 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYL1P12980 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYL1P12980 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYL1P12980 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYL1P12980 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYL1P12980 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYL1P12980 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYL1P12980 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYL1P12980 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYL1P12980 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYL1P12980 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYL1P12980 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYL1P12980 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYL1P12980 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYL1P12980 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms