Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms