Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHGAP10645 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHGAP10645 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHGAP10645 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CHGAP10645 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CHGAP10645 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHGAP10645 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHGAP10645 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHGAP10645 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CHGAP10645 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHGAP10645 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHGAP10645 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHGAP10645 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHGAP10645 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHGAP10645 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHGAP10645 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CHGAP10645 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CHGAP10645 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHGAP10645 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CHGAP10645 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHGAP10645 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHGAP10645 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHGAP10645 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHGAP10645 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHGAP10645 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHGAP10645 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHGAP10645 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHGAP10645 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHGAP10645 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CHGAP10645 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHGAP10645 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHGAP10645 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHGAP10645 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHGAP10645 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHGAP10645 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CHGAP10645 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHGAP10645 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHGAP10645 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHGAP10645 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHGAP10645 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHGAP10645 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHGAP10645 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHGAP10645 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHGAP10645 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHGAP10645 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHGAP10645 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CHGAP10645 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHGAP10645 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHGAP10645 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHGAP10645 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CHGAP10645 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHGAP10645 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHGAP10645 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHGAP10645 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHGAP10645 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CHGAP10645 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHGAP10645 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHGAP10645 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHGAP10645 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHGAP10645 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHGAP10645 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CHGAP10645 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHGAP10645 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CHGAP10645 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHGAP10645 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHGAP10645 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHGAP10645 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHGAP10645 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHGAP10645 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHGAP10645 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHGAP10645 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHGAP10645 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHGAP10645 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHGAP10645 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHGAP10645 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHGAP10645 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHGAP10645 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHGAP10645 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHGAP10645 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHGAP10645 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CHGAP10645 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHGAP10645 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CHGAP10645 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHGAP10645 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHGAP10645 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHGAP10645 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHGAP10645 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHGAP10645 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHGAP10645 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHGAP10645 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHGAP10645 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHGAP10645 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHGAP10645 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHGAP10645 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHGAP10645 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHGAP10645 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHGAP10645 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHGAP10645 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHGAP10645 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHGAP10645 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms