Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CGB3P0DN86 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms