Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms