Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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PKHD1P08F94 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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PKHD1P08F94 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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PKHD1P08F94 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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