Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB1P08034 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB1P08034 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB1P08034 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB1P08034 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB1P08034 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB1P08034 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB1P08034 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB1P08034 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB1P08034 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB1P08034 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB1P08034 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB1P08034 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB1P08034 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB1P08034 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB1P08034 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB1P08034 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB1P08034 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB1P08034 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB1P08034 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB1P08034 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB1P08034 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB1P08034 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB1P08034 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB1P08034 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB1P08034 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB1P08034 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB1P08034 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB1P08034 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB1P08034 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB1P08034 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB1P08034 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB1P08034 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB1P08034 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB1P08034 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB1P08034 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB1P08034 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB1P08034 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB1P08034 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB1P08034 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB1P08034 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB1P08034 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB1P08034 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB1P08034 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB1P08034 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB1P08034 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB1P08034 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB1P08034 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB1P08034 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB1P08034 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB1P08034 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB1P08034 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB1P08034 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB1P08034 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB1P08034 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB1P08034 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB1P08034 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB1P08034 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB1P08034 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB1P08034 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB1P08034 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB1P08034 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB1P08034 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB1P08034 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB1P08034 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB1P08034 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB1P08034 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB1P08034 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB1P08034 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB1P08034 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB1P08034 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB1P08034 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB1P08034 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB1P08034 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB1P08034 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB1P08034 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB1P08034 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB1P08034 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB1P08034 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB1P08034 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB1P08034 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB1P08034 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB1P08034 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB1P08034 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB1P08034 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB1P08034 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB1P08034 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB1P08034 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB1P08034 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB1P08034 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB1P08034 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB1P08034 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB1P08034 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB1P08034 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB1P08034 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB1P08034 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB1P08034 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB1P08034 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB1P08034 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB1P08034 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms