Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms