Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPBP07199 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPBP07199 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPBP07199 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPBP07199 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPBP07199 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPBP07199 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPBP07199 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPBP07199 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPBP07199 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPBP07199 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPBP07199 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPBP07199 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPBP07199 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPBP07199 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPBP07199 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPBP07199 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPBP07199 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPBP07199 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPBP07199 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPBP07199 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPBP07199 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPBP07199 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPBP07199 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPBP07199 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPBP07199 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPBP07199 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPBP07199 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPBP07199 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPBP07199 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPBP07199 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPBP07199 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPBP07199 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPBP07199 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPBP07199 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPBP07199 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPBP07199 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPBP07199 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPBP07199 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPBP07199 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPBP07199 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPBP07199 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPBP07199 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPBP07199 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPBP07199 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPBP07199 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPBP07199 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPBP07199 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPBP07199 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPBP07199 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPBP07199 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPBP07199 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CENPBP07199 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CENPBP07199 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CENPBP07199 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CENPBP07199 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CENPBP07199 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CENPBP07199 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CENPBP07199 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CENPBP07199 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CENPBP07199 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CENPBP07199 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CENPBP07199 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CENPBP07199 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CENPBP07199 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPBP07199 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPBP07199 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPBP07199 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPBP07199 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPBP07199 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPBP07199 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPBP07199 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPBP07199 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPBP07199 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPBP07199 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPBP07199 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPBP07199 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPBP07199 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPBP07199 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPBP07199 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPBP07199 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPBP07199 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPBP07199 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPBP07199 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPBP07199 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPBP07199 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPBP07199 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPBP07199 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPBP07199 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPBP07199 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPBP07199 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPBP07199 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPBP07199 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPBP07199 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPBP07199 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPBP07199 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPBP07199 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPBP07199 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPBP07199 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPBP07199 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms