Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFLP07196 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEFLP07196 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEFLP07196 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEFLP07196 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEFLP07196 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEFLP07196 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFLP07196 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFLP07196 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFLP07196 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFLP07196 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFLP07196 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFLP07196 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFLP07196 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFLP07196 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFLP07196 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFLP07196 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFLP07196 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFLP07196 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFLP07196 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFLP07196 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFLP07196 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFLP07196 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFLP07196 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFLP07196 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFLP07196 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFLP07196 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFLP07196 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFLP07196 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFLP07196 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFLP07196 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFLP07196 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFLP07196 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFLP07196 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFLP07196 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFLP07196 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFLP07196 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFLP07196 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFLP07196 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFLP07196 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFLP07196 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFLP07196 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFLP07196 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFLP07196 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFLP07196 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFLP07196 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFLP07196 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFLP07196 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFLP07196 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFLP07196 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFLP07196 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFLP07196 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFLP07196 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFLP07196 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFLP07196 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFLP07196 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFLP07196 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFLP07196 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFLP07196 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFLP07196 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFLP07196 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFLP07196 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFLP07196 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFLP07196 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFLP07196 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFLP07196 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFLP07196 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFLP07196 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFLP07196 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFLP07196 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFLP07196 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFLP07196 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFLP07196 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFLP07196 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFLP07196 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFLP07196 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFLP07196 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFLP07196 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFLP07196 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFLP07196 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFLP07196 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFLP07196 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFLP07196 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFLP07196 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFLP07196 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFLP07196 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFLP07196 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFLP07196 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFLP07196 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFLP07196 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFLP07196 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFLP07196 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFLP07196 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFLP07196 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFLP07196 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFLP07196 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFLP07196 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFLP07196 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFLP07196 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFLP07196 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms