Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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CLDN9O95484 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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CLDN9O95484 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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CLDN9O95484 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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CLDN9O95484 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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CLDN9O95484 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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CLDN9O95484 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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CLDN9O95484 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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CLDN9O95484 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
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