Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL3O95236 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL3O95236 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL3O95236 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL3O95236 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL3O95236 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL3O95236 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL3O95236 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL3O95236 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL3O95236 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL3O95236 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL3O95236 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL3O95236 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL3O95236 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL3O95236 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL3O95236 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL3O95236 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL3O95236 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL3O95236 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL3O95236 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL3O95236 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL3O95236 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL3O95236 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL3O95236 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL3O95236 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL3O95236 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL3O95236 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL3O95236 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL3O95236 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL3O95236 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL3O95236 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL3O95236 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL3O95236 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL3O95236 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL3O95236 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL3O95236 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL3O95236 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL3O95236 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL3O95236 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL3O95236 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL3O95236 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL3O95236 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL3O95236 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL3O95236 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL3O95236 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL3O95236 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL3O95236 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL3O95236 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL3O95236 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL3O95236 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL3O95236 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL3O95236 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL3O95236 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL3O95236 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL3O95236 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL3O95236 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL3O95236 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL3O95236 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL3O95236 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL3O95236 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL3O95236 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL3O95236 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL3O95236 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL3O95236 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL3O95236 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL3O95236 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL3O95236 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL3O95236 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL3O95236 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL3O95236 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL3O95236 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL3O95236 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL3O95236 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL3O95236 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL3O95236 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL3O95236 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL3O95236 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL3O95236 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL3O95236 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL3O95236 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL3O95236 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL3O95236 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL3O95236 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL3O95236 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL3O95236 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL3O95236 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL3O95236 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL3O95236 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOL3O95236 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOL3O95236 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOL3O95236 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOL3O95236 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOL3O95236 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOL3O95236 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOL3O95236 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOL3O95236 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOL3O95236 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOL3O95236 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOL3O95236 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOL3O95236 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms