Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms