Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPLO60437 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPLO60437 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPLO60437 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPLO60437 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPLO60437 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPLO60437 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPLO60437 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPLO60437 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PPLO60437 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PPLO60437 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPLO60437 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPLO60437 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPLO60437 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPLO60437 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPLO60437 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PPLO60437 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPLO60437 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPLO60437 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPLO60437 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPLO60437 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PPLO60437 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPLO60437 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPLO60437 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPLO60437 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPLO60437 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPLO60437 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPLO60437 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPLO60437 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPLO60437 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPLO60437 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPLO60437 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPLO60437 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PPLO60437 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPLO60437 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPLO60437 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPLO60437 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPLO60437 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPLO60437 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPLO60437 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPLO60437 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPLO60437 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPLO60437 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPLO60437 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PPLO60437 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPLO60437 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPLO60437 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPLO60437 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPLO60437 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPLO60437 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPLO60437 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPLO60437 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPLO60437 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPLO60437 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPLO60437 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPLO60437 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PPLO60437 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPLO60437 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPLO60437 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPLO60437 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPLO60437 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPLO60437 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPLO60437 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPLO60437 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPLO60437 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPLO60437 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPLO60437 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPLO60437 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPLO60437 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPLO60437 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPLO60437 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPLO60437 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPLO60437 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PPLO60437 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPLO60437 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPLO60437 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPLO60437 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPLO60437 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPLO60437 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPLO60437 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPLO60437 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPLO60437 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PPLO60437 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPLO60437 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPLO60437 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPLO60437 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPLO60437 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPLO60437 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPLO60437 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPLO60437 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPLO60437 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPLO60437 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PPLO60437 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PPLO60437 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
PPLO60437 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PPLO60437 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
PPLO60437 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PPLO60437 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PPLO60437 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPLO60437 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms