Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DENRO43583 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DENRO43583 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DENRO43583 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DENRO43583 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DENRO43583 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DENRO43583 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DENRO43583 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DENRO43583 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DENRO43583 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DENRO43583 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DENRO43583 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DENRO43583 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DENRO43583 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DENRO43583 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DENRO43583 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DENRO43583 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DENRO43583 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DENRO43583 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DENRO43583 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DENRO43583 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DENRO43583 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DENRO43583 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DENRO43583 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DENRO43583 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DENRO43583 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DENRO43583 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DENRO43583 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DENRO43583 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DENRO43583 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DENRO43583 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DENRO43583 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DENRO43583 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DENRO43583 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DENRO43583 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DENRO43583 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DENRO43583 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DENRO43583 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DENRO43583 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DENRO43583 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DENRO43583 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DENRO43583 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DENRO43583 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DENRO43583 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DENRO43583 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DENRO43583 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DENRO43583 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DENRO43583 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DENRO43583 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DENRO43583 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DENRO43583 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DENRO43583 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DENRO43583 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DENRO43583 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DENRO43583 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DENRO43583 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DENRO43583 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DENRO43583 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DENRO43583 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DENRO43583 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DENRO43583 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DENRO43583 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DENRO43583 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DENRO43583 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DENRO43583 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DENRO43583 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DENRO43583 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DENRO43583 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DENRO43583 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DENRO43583 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DENRO43583 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DENRO43583 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DENRO43583 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DENRO43583 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DENRO43583 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DENRO43583 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DENRO43583 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DENRO43583 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DENRO43583 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DENRO43583 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DENRO43583 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DENRO43583 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DENRO43583 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DENRO43583 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DENRO43583 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DENRO43583 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DENRO43583 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DENRO43583 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DENRO43583 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DENRO43583 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DENRO43583 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DENRO43583 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DENRO43583 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DENRO43583 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DENRO43583 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DENRO43583 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DENRO43583 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DENRO43583 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DENRO43583 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DENRO43583 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms