Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM6AO15550 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms